Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Kcns1O35173 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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