Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casq1O09165 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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