Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sec22bO08547 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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