Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim18J3QNP2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms