Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc180J3QNE4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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