Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3336J3QMQ6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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