Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21977F6U3N7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms