Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf212F6TQD1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rnf212F6TQD1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rnf212F6TQD1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rnf212F6TQD1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rnf212F6TQD1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rnf212F6TQD1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rnf212F6TQD1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rnf212F6TQD1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rnf212F6TQD1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rnf212F6TQD1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rnf212F6TQD1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rnf212F6TQD1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf212F6TQD1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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