Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85cE9Q6B2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms