Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms