Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.2 ms