Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ddx60E9PZQ1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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