Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brd1E9PZ26 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms