Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gcn1E9PVA8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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