Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm3543D3Z235 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm3543D3Z235 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm3543D3Z235 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm3543D3Z235 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm3543D3Z235 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm3543D3Z235 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm3543D3Z235 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm3543D3Z235 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm3543D3Z235 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm3543D3Z235 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm3543D3Z235 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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