Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms