Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf1B2RRD7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms