Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms