Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Palm3A2TJV2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms