Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms