Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RNP2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RNP2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms