Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Cldn8Q9Z260 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn8Q9Z260 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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