Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trpc2Q9R244 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trpc2Q9R244 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trpc2Q9R244 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trpc2Q9R244 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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