Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a3Q9QZS0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Col4a3Q9QZS0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a3Q9QZS0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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