Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms