Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Col5a3Q9JLI2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms