Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Prg3Q9JL95 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Prg3Q9JL95 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Prg3Q9JL95 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Prg3Q9JL95 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Prg3Q9JL95 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Prg3Q9JL95 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Prg3Q9JL95 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Prg3Q9JL95 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Prg3Q9JL95 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Prg3Q9JL95 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Prg3Q9JL95 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Prg3Q9JL95 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Prg3Q9JL95 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prg3Q9JL95 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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