Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl28Q9JIL2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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