Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim39Q9ESN2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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