Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clstn2Q9ER65 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clstn2Q9ER65 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms