Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9DAA3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9DAA3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms