Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cldn34b2Q9D9N2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cldn34b2Q9D9N2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cldn34b2Q9D9N2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b2Q9D9N2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b2Q9D9N2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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