Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms