Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms