Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Capns2Q9D7J7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capns2Q9D7J7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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