Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PudpQ9D5U5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PudpQ9D5U5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PudpQ9D5U5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PudpQ9D5U5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PudpQ9D5U5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PudpQ9D5U5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PudpQ9D5U5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PudpQ9D5U5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PudpQ9D5U5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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PudpQ9D5U5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PudpQ9D5U5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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