Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms