Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Shisa9Q9CZN4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Shisa9Q9CZN4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Shisa9Q9CZN4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Shisa9Q9CZN4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1058.9 ms