Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG3

Commd8, COMM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd8Q9CZG3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd8Q9CZG3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Commd8Q9CZG3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms