Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2fQ9CY34 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ube2fQ9CY34 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ube2fQ9CY34 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ube2fQ9CY34 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ube2fQ9CY34 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ube2fQ9CY34 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ube2fQ9CY34 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ube2fQ9CY34 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2fQ9CY34 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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