Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rdm1Q9CQK3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rdm1Q9CQK3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms