Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms