Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Bhlhe41Q99PV5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms