Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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