Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubqln4Q99NB8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms