Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac9Q99N13 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms