Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SrrtQ99MR6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms