Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ciao1Q99KN2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ciao1Q99KN2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ciao1Q99KN2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ciao1Q99KN2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ciao1Q99KN2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ciao1Q99KN2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ciao1Q99KN2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ciao1Q99KN2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ciao1Q99KN2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ciao1Q99KN2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ciao1Q99KN2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ciao1Q99KN2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ciao1Q99KN2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ciao1Q99KN2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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