Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlgn1Q99K10 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nlgn1Q99K10 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms