Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim11aQ99J19 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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